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本产品仅供科研实验,不得用于医疗或食用。引物设计与合成试验检测

在PCR(聚合酶链式反应)技术中,已知一段目基因核苷酸序列,根据这一序

列合成引物,利用PCR扩增技术,目基因DNA受热变性后解链为单链,引物与单链相应互补序列结合,然后在DNA

聚合酶作用下进行延伸,如此重复循环,延伸后得到产物同样可以和引物结合。PCR引物设计目是找到一对合

适核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。如前述,引物优劣直接关系到PCR特异性与成功与否。对引

物设计不可能有一种包罗万象规则确保PCR成功,但遵循某些原则,则有助于引物设计。折叠引物*佳设

定区域

DNA序列保守区是通过物种间相似序列比较确定。在NCBI上搜索不同物种同一基因,通过序列分析软件

引物设计与合成试验检测

(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同序列就是该基因保守区。折叠引物长度一般在15~30碱基之间

引物长度(primer length)常用是18-27 bp,但不应大于38,因为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于

Taq DNA 聚合酶进行反应。折叠引物GC含量在40%~60%间,Tm值近72℃
GC含量(composition)过高或过低都不利于引发反应。上下游引物GC含量不能相差太大。另外,上下游引物

Tm值(melting temperature)是寡核苷酸解链温度,即在一定盐浓度条件下,50%寡核苷酸双链解链温度。有效

启动温度,一般高于Tm值5~10℃。若按公式Tm= 4(G+C)+2(A+T)估计引物Tm值,则有效引物Tm为

55~80℃,其Tm值接近72℃以使复性条件*佳。引物长度(primer length)常用是18-27 bp,但不应大于38,因

为过长会导致其延伸温度大于74℃,不适于

Taq DNA 聚合酶进行反应。折叠引物GC含量在40%~60%间,Tm值近72℃

GC含量(composition)过高或过低都不利于引发反应。上下游引物GC含量不能相差太大。另外,上下游引物

Tm值(melting temperature)是寡核苷酸解链温度,即在一定盐浓度条件下,50%寡核苷酸双链解链温度。有效

启动温度,一般高于Tm值5~10℃。若按公式Tm= 4(G+C)+2(A+T)估计引物Tm值,则有效引物Tm为

55~80℃,其Tm值接近72℃以使复性条件*佳。 

引物设计与合成试验检测

更新时间:2026/2/11 7:09:42

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